Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt35Q497I4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt35Q497I4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt35Q497I4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt35Q497I4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt35Q497I4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt35Q497I4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt35Q497I4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt35Q497I4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt35Q497I4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt35Q497I4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt35Q497I4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt35Q497I4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt35Q497I4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt35Q497I4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt35Q497I4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt35Q497I4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt35Q497I4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt35Q497I4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt35Q497I4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt35Q497I4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt35Q497I4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt35Q497I4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt35Q497I4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt35Q497I4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt35Q497I4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt35Q497I4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt35Q497I4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt35Q497I4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt35Q497I4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt35Q497I4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt35Q497I4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt35Q497I4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt35Q497I4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt35Q497I4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt35Q497I4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt35Q497I4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt35Q497I4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt35Q497I4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt35Q497I4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt35Q497I4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt35Q497I4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt35Q497I4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt35Q497I4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt35Q497I4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt35Q497I4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt35Q497I4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt35Q497I4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt35Q497I4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt35Q497I4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt35Q497I4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt35Q497I4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt35Q497I4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt35Q497I4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt35Q497I4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt35Q497I4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt35Q497I4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt35Q497I4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt35Q497I4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt35Q497I4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt35Q497I4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt35Q497I4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt35Q497I4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt35Q497I4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Krt35Q497I4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt35Q497I4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt35Q497I4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt35Q497I4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt35Q497I4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt35Q497I4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt35Q497I4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt35Q497I4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt35Q497I4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt35Q497I4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt35Q497I4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt35Q497I4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt35Q497I4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt35Q497I4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt35Q497I4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt35Q497I4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt35Q497I4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt35Q497I4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt35Q497I4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt35Q497I4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt35Q497I4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt35Q497I4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt35Q497I4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt35Q497I4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt35Q497I4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt35Q497I4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt35Q497I4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt35Q497I4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt35Q497I4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt35Q497I4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt35Q497I4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt35Q497I4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt35Q497I4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt35Q497I4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms