Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc185Q3V118 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc185Q3V118 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc185Q3V118 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc185Q3V118 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc185Q3V118 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc185Q3V118 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc185Q3V118 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc185Q3V118 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc185Q3V118 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc185Q3V118 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc185Q3V118 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc185Q3V118 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc185Q3V118 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc185Q3V118 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc185Q3V118 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc185Q3V118 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc185Q3V118 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc185Q3V118 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc185Q3V118 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc185Q3V118 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc185Q3V118 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc185Q3V118 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc185Q3V118 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc185Q3V118 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc185Q3V118 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc185Q3V118 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc185Q3V118 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc185Q3V118 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc185Q3V118 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc185Q3V118 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc185Q3V118 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc185Q3V118 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc185Q3V118 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc185Q3V118 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc185Q3V118 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc185Q3V118 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc185Q3V118 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc185Q3V118 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc185Q3V118 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc185Q3V118 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc185Q3V118 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc185Q3V118 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc185Q3V118 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc185Q3V118 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc185Q3V118 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc185Q3V118 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc185Q3V118 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc185Q3V118 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc185Q3V118 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc185Q3V118 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc185Q3V118 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc185Q3V118 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc185Q3V118 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc185Q3V118 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc185Q3V118 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc185Q3V118 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc185Q3V118 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc185Q3V118 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc185Q3V118 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc185Q3V118 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms