Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slfn4Q3UV66 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slfn4Q3UV66 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slfn4Q3UV66 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slfn4Q3UV66 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slfn4Q3UV66 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slfn4Q3UV66 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slfn4Q3UV66 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slfn4Q3UV66 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slfn4Q3UV66 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slfn4Q3UV66 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slfn4Q3UV66 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slfn4Q3UV66 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slfn4Q3UV66 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slfn4Q3UV66 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slfn4Q3UV66 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Slfn4Q3UV66 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slfn4Q3UV66 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slfn4Q3UV66 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slfn4Q3UV66 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Slfn4Q3UV66 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slfn4Q3UV66 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slfn4Q3UV66 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slfn4Q3UV66 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slfn4Q3UV66 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slfn4Q3UV66 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slfn4Q3UV66 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slfn4Q3UV66 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slfn4Q3UV66 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slfn4Q3UV66 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slfn4Q3UV66 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slfn4Q3UV66 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slfn4Q3UV66 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slfn4Q3UV66 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slfn4Q3UV66 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Slfn4Q3UV66 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slfn4Q3UV66 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms