Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm28047Q3US59 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm28047Q3US59 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm28047Q3US59 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm28047Q3US59 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm28047Q3US59 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm28047Q3US59 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm28047Q3US59 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm28047Q3US59 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm28047Q3US59 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm28047Q3US59 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm28047Q3US59 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm28047Q3US59 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm28047Q3US59 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm28047Q3US59 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm28047Q3US59 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm28047Q3US59 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm28047Q3US59 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm28047Q3US59 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm28047Q3US59 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm28047Q3US59 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm28047Q3US59 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm28047Q3US59 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm28047Q3US59 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm28047Q3US59 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm28047Q3US59 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm28047Q3US59 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm28047Q3US59 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm28047Q3US59 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm28047Q3US59 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm28047Q3US59 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm28047Q3US59 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm28047Q3US59 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm28047Q3US59 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm28047Q3US59 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm28047Q3US59 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm28047Q3US59 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm28047Q3US59 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm28047Q3US59 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm28047Q3US59 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm28047Q3US59 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm28047Q3US59 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm28047Q3US59 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm28047Q3US59 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm28047Q3US59 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm28047Q3US59 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm28047Q3US59 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm28047Q3US59 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm28047Q3US59 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm28047Q3US59 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm28047Q3US59 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm28047Q3US59 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm28047Q3US59 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm28047Q3US59 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm28047Q3US59 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm28047Q3US59 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm28047Q3US59 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm28047Q3US59 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm28047Q3US59 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm28047Q3US59 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm28047Q3US59 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm28047Q3US59 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm28047Q3US59 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm28047Q3US59 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm28047Q3US59 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm28047Q3US59 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm28047Q3US59 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm28047Q3US59 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm28047Q3US59 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm28047Q3US59 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm28047Q3US59 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm28047Q3US59 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm28047Q3US59 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm28047Q3US59 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm28047Q3US59 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm28047Q3US59 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm28047Q3US59 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm28047Q3US59 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm28047Q3US59 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm28047Q3US59 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm28047Q3US59 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm28047Q3US59 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm28047Q3US59 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm28047Q3US59 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm28047Q3US59 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm28047Q3US59 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm28047Q3US59 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms