Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prrc1Q3UPH1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prrc1Q3UPH1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrc1Q3UPH1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms