Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nhlrc4Q3UP44 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nhlrc4Q3UP44 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nhlrc4Q3UP44 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nhlrc4Q3UP44 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nhlrc4Q3UP44 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nhlrc4Q3UP44 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nhlrc4Q3UP44 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nhlrc4Q3UP44 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nhlrc4Q3UP44 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nhlrc4Q3UP44 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nhlrc4Q3UP44 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nhlrc4Q3UP44 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nhlrc4Q3UP44 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nhlrc4Q3UP44 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nhlrc4Q3UP44 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nhlrc4Q3UP44 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nhlrc4Q3UP44 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nhlrc4Q3UP44 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nhlrc4Q3UP44 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nhlrc4Q3UP44 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nhlrc4Q3UP44 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nhlrc4Q3UP44 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nhlrc4Q3UP44 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nhlrc4Q3UP44 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nhlrc4Q3UP44 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nhlrc4Q3UP44 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nhlrc4Q3UP44 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nhlrc4Q3UP44 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nhlrc4Q3UP44 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nhlrc4Q3UP44 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nhlrc4Q3UP44 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nhlrc4Q3UP44 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nhlrc4Q3UP44 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nhlrc4Q3UP44 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nhlrc4Q3UP44 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nhlrc4Q3UP44 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nhlrc4Q3UP44 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nhlrc4Q3UP44 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nhlrc4Q3UP44 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nhlrc4Q3UP44 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nhlrc4Q3UP44 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nhlrc4Q3UP44 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nhlrc4Q3UP44 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nhlrc4Q3UP44 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nhlrc4Q3UP44 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nhlrc4Q3UP44 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nhlrc4Q3UP44 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nhlrc4Q3UP44 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nhlrc4Q3UP44 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nhlrc4Q3UP44 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nhlrc4Q3UP44 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nhlrc4Q3UP44 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nhlrc4Q3UP44 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nhlrc4Q3UP44 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nhlrc4Q3UP44 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms