Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMT1

Ppp1r12c, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12C, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r12cQ3UMT1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r12cQ3UMT1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r12cQ3UMT1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r12cQ3UMT1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r12cQ3UMT1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r12cQ3UMT1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r12cQ3UMT1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r12cQ3UMT1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r12cQ3UMT1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r12cQ3UMT1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppp1r12cQ3UMT1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r12cQ3UMT1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r12cQ3UMT1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r12cQ3UMT1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r12cQ3UMT1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r12cQ3UMT1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r12cQ3UMT1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ppp1r12cQ3UMT1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp1r12cQ3UMT1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp1r12cQ3UMT1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp1r12cQ3UMT1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp1r12cQ3UMT1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp1r12cQ3UMT1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp1r12cQ3UMT1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp1r12cQ3UMT1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp1r12cQ3UMT1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp1r12cQ3UMT1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r12cQ3UMT1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r12cQ3UMT1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r12cQ3UMT1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r12cQ3UMT1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r12cQ3UMT1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r12cQ3UMT1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r12cQ3UMT1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r12cQ3UMT1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r12cQ3UMT1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r12cQ3UMT1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r12cQ3UMT1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r12cQ3UMT1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r12cQ3UMT1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r12cQ3UMT1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r12cQ3UMT1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r12cQ3UMT1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r12cQ3UMT1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r12cQ3UMT1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r12cQ3UMT1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r12cQ3UMT1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r12cQ3UMT1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r12cQ3UMT1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r12cQ3UMT1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp1r12cQ3UMT1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp1r12cQ3UMT1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp1r12cQ3UMT1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r12cQ3UMT1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r12cQ3UMT1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r12cQ3UMT1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r12cQ3UMT1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r12cQ3UMT1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r12cQ3UMT1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r12cQ3UMT1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r12cQ3UMT1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r12cQ3UMT1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r12cQ3UMT1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r12cQ3UMT1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r12cQ3UMT1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r12cQ3UMT1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r12cQ3UMT1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r12cQ3UMT1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r12cQ3UMT1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r12cQ3UMT1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r12cQ3UMT1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r12cQ3UMT1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1r12cQ3UMT1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1r12cQ3UMT1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1r12cQ3UMT1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp1r12cQ3UMT1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp1r12cQ3UMT1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp1r12cQ3UMT1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp1r12cQ3UMT1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp1r12cQ3UMT1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp1r12cQ3UMT1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp1r12cQ3UMT1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ppp1r12cQ3UMT1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp1r12cQ3UMT1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp1r12cQ3UMT1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp1r12cQ3UMT1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp1r12cQ3UMT1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp1r12cQ3UMT1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp1r12cQ3UMT1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp1r12cQ3UMT1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp1r12cQ3UMT1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp1r12cQ3UMT1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms