Protein–RNA interactions for Protein: Q3UME2

Tmem241, Transmembrane protein 241, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem241Q3UME2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem241Q3UME2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem241Q3UME2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem241Q3UME2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem241Q3UME2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem241Q3UME2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem241Q3UME2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem241Q3UME2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem241Q3UME2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem241Q3UME2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem241Q3UME2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem241Q3UME2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem241Q3UME2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem241Q3UME2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem241Q3UME2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem241Q3UME2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem241Q3UME2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem241Q3UME2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem241Q3UME2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.3 ms