Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ell2Q3UKU1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ell2Q3UKU1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ell2Q3UKU1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ell2Q3UKU1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ell2Q3UKU1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ell2Q3UKU1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ell2Q3UKU1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ell2Q3UKU1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ell2Q3UKU1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ell2Q3UKU1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ell2Q3UKU1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ell2Q3UKU1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ell2Q3UKU1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ell2Q3UKU1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ell2Q3UKU1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ell2Q3UKU1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ell2Q3UKU1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ell2Q3UKU1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ell2Q3UKU1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ell2Q3UKU1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ell2Q3UKU1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ell2Q3UKU1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ell2Q3UKU1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ell2Q3UKU1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ell2Q3UKU1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ell2Q3UKU1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ell2Q3UKU1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ell2Q3UKU1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ell2Q3UKU1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ell2Q3UKU1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ell2Q3UKU1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ell2Q3UKU1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ell2Q3UKU1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ell2Q3UKU1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ell2Q3UKU1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ell2Q3UKU1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ell2Q3UKU1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ell2Q3UKU1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ell2Q3UKU1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ell2Q3UKU1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ell2Q3UKU1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ell2Q3UKU1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ell2Q3UKU1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ell2Q3UKU1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ell2Q3UKU1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ell2Q3UKU1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ell2Q3UKU1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ell2Q3UKU1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ell2Q3UKU1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ell2Q3UKU1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ell2Q3UKU1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ell2Q3UKU1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ell2Q3UKU1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ell2Q3UKU1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ell2Q3UKU1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ell2Q3UKU1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ell2Q3UKU1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ell2Q3UKU1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ell2Q3UKU1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ell2Q3UKU1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ell2Q3UKU1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ell2Q3UKU1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ell2Q3UKU1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ell2Q3UKU1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ell2Q3UKU1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ell2Q3UKU1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ell2Q3UKU1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ell2Q3UKU1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ell2Q3UKU1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ell2Q3UKU1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ell2Q3UKU1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ell2Q3UKU1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ell2Q3UKU1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ell2Q3UKU1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ell2Q3UKU1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ell2Q3UKU1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ell2Q3UKU1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ell2Q3UKU1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ell2Q3UKU1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ell2Q3UKU1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ell2Q3UKU1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ell2Q3UKU1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ell2Q3UKU1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ell2Q3UKU1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ell2Q3UKU1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ell2Q3UKU1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ell2Q3UKU1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ell2Q3UKU1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ell2Q3UKU1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ell2Q3UKU1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ell2Q3UKU1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ell2Q3UKU1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ell2Q3UKU1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ell2Q3UKU1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ell2Q3UKU1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ell2Q3UKU1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ell2Q3UKU1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ell2Q3UKU1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ell2Q3UKU1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms