Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpr55Q3UJF0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpr55Q3UJF0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpr55Q3UJF0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpr55Q3UJF0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpr55Q3UJF0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpr55Q3UJF0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpr55Q3UJF0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpr55Q3UJF0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gpr55Q3UJF0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpr55Q3UJF0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms