Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Edc4Q3UJB9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Edc4Q3UJB9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Edc4Q3UJB9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Edc4Q3UJB9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Edc4Q3UJB9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Edc4Q3UJB9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Edc4Q3UJB9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Edc4Q3UJB9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Edc4Q3UJB9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Edc4Q3UJB9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Edc4Q3UJB9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Edc4Q3UJB9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Edc4Q3UJB9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Edc4Q3UJB9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Edc4Q3UJB9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Edc4Q3UJB9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.6
Edc4Q3UJB9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Edc4Q3UJB9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Edc4Q3UJB9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Edc4Q3UJB9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Edc4Q3UJB9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Edc4Q3UJB9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Edc4Q3UJB9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Edc4Q3UJB9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Edc4Q3UJB9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Edc4Q3UJB9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Edc4Q3UJB9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Edc4Q3UJB9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Edc4Q3UJB9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Edc4Q3UJB9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Edc4Q3UJB9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Edc4Q3UJB9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Edc4Q3UJB9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Edc4Q3UJB9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Edc4Q3UJB9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Edc4Q3UJB9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Edc4Q3UJB9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Edc4Q3UJB9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Edc4Q3UJB9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Edc4Q3UJB9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Edc4Q3UJB9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Edc4Q3UJB9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Edc4Q3UJB9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Edc4Q3UJB9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Edc4Q3UJB9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Edc4Q3UJB9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Edc4Q3UJB9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Edc4Q3UJB9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Edc4Q3UJB9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Edc4Q3UJB9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Edc4Q3UJB9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Edc4Q3UJB9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Edc4Q3UJB9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Edc4Q3UJB9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Edc4Q3UJB9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Edc4Q3UJB9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Edc4Q3UJB9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Edc4Q3UJB9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Edc4Q3UJB9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Edc4Q3UJB9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Edc4Q3UJB9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Edc4Q3UJB9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Edc4Q3UJB9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Edc4Q3UJB9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Edc4Q3UJB9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Edc4Q3UJB9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Edc4Q3UJB9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Edc4Q3UJB9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Edc4Q3UJB9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
Edc4Q3UJB9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Edc4Q3UJB9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Edc4Q3UJB9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Edc4Q3UJB9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Edc4Q3UJB9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Edc4Q3UJB9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Edc4Q3UJB9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Edc4Q3UJB9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Edc4Q3UJB9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
Edc4Q3UJB9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Edc4Q3UJB9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Edc4Q3UJB9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Edc4Q3UJB9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Edc4Q3UJB9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Edc4Q3UJB9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Edc4Q3UJB9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Edc4Q3UJB9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
Edc4Q3UJB9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Edc4Q3UJB9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Edc4Q3UJB9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Edc4Q3UJB9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Edc4Q3UJB9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Edc4Q3UJB9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Edc4Q3UJB9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Edc4Q3UJB9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Edc4Q3UJB9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Edc4Q3UJB9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Edc4Q3UJB9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Edc4Q3UJB9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Edc4Q3UJB9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms