Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Zswim8Q3UHH1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zswim8Q3UHH1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zswim8Q3UHH1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zswim8Q3UHH1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zswim8Q3UHH1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zswim8Q3UHH1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zswim8Q3UHH1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zswim8Q3UHH1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Zswim8Q3UHH1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Zswim8Q3UHH1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Zswim8Q3UHH1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Zswim8Q3UHH1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Zswim8Q3UHH1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Zswim8Q3UHH1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zswim8Q3UHH1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zswim8Q3UHH1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zswim8Q3UHH1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Zswim8Q3UHH1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Zswim8Q3UHH1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Zswim8Q3UHH1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Zswim8Q3UHH1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Zswim8Q3UHH1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Zswim8Q3UHH1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Zswim8Q3UHH1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Zswim8Q3UHH1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zswim8Q3UHH1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zswim8Q3UHH1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zswim8Q3UHH1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zswim8Q3UHH1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Zswim8Q3UHH1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zswim8Q3UHH1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zswim8Q3UHH1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zswim8Q3UHH1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zswim8Q3UHH1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zswim8Q3UHH1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zswim8Q3UHH1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zswim8Q3UHH1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zswim8Q3UHH1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Zswim8Q3UHH1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zswim8Q3UHH1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zswim8Q3UHH1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zswim8Q3UHH1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Zswim8Q3UHH1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Zswim8Q3UHH1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Zswim8Q3UHH1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Zswim8Q3UHH1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Zswim8Q3UHH1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Zswim8Q3UHH1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Zswim8Q3UHH1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zswim8Q3UHH1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zswim8Q3UHH1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zswim8Q3UHH1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zswim8Q3UHH1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zswim8Q3UHH1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Zswim8Q3UHH1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zswim8Q3UHH1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zswim8Q3UHH1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zswim8Q3UHH1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zswim8Q3UHH1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zswim8Q3UHH1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zswim8Q3UHH1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zswim8Q3UHH1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zswim8Q3UHH1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zswim8Q3UHH1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zswim8Q3UHH1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zswim8Q3UHH1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zswim8Q3UHH1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zswim8Q3UHH1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zswim8Q3UHH1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zswim8Q3UHH1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zswim8Q3UHH1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Zswim8Q3UHH1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Zswim8Q3UHH1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Zswim8Q3UHH1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zswim8Q3UHH1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zswim8Q3UHH1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Zswim8Q3UHH1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zswim8Q3UHH1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zswim8Q3UHH1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zswim8Q3UHH1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zswim8Q3UHH1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zswim8Q3UHH1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zswim8Q3UHH1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zswim8Q3UHH1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zswim8Q3UHH1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zswim8Q3UHH1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Zswim8Q3UHH1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zswim8Q3UHH1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zswim8Q3UHH1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zswim8Q3UHH1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zswim8Q3UHH1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zswim8Q3UHH1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Zswim8Q3UHH1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zswim8Q3UHH1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zswim8Q3UHH1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Zswim8Q3UHH1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Zswim8Q3UHH1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zswim8Q3UHH1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zswim8Q3UHH1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms