Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Garem1Q3UFT3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Garem1Q3UFT3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Garem1Q3UFT3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Garem1Q3UFT3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Garem1Q3UFT3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Garem1Q3UFT3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Garem1Q3UFT3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Garem1Q3UFT3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Garem1Q3UFT3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Garem1Q3UFT3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Garem1Q3UFT3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Garem1Q3UFT3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Garem1Q3UFT3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Garem1Q3UFT3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Garem1Q3UFT3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Garem1Q3UFT3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Garem1Q3UFT3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Garem1Q3UFT3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Garem1Q3UFT3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Garem1Q3UFT3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Garem1Q3UFT3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Garem1Q3UFT3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Garem1Q3UFT3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Garem1Q3UFT3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Garem1Q3UFT3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Garem1Q3UFT3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Garem1Q3UFT3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Garem1Q3UFT3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Garem1Q3UFT3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Garem1Q3UFT3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Garem1Q3UFT3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Garem1Q3UFT3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Garem1Q3UFT3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Garem1Q3UFT3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Garem1Q3UFT3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Garem1Q3UFT3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Garem1Q3UFT3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Garem1Q3UFT3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Garem1Q3UFT3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Garem1Q3UFT3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Garem1Q3UFT3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Garem1Q3UFT3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Garem1Q3UFT3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Garem1Q3UFT3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Garem1Q3UFT3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Garem1Q3UFT3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Garem1Q3UFT3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Garem1Q3UFT3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Garem1Q3UFT3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Garem1Q3UFT3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms