Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEZ8

Slc10a4, Sodium/bile acid cotransporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc10a4Q3UEZ8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc10a4Q3UEZ8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc10a4Q3UEZ8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc10a4Q3UEZ8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc10a4Q3UEZ8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc10a4Q3UEZ8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc10a4Q3UEZ8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc10a4Q3UEZ8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc10a4Q3UEZ8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc10a4Q3UEZ8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc10a4Q3UEZ8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc10a4Q3UEZ8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc10a4Q3UEZ8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc10a4Q3UEZ8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc10a4Q3UEZ8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc10a4Q3UEZ8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc10a4Q3UEZ8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc10a4Q3UEZ8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc10a4Q3UEZ8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc10a4Q3UEZ8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc10a4Q3UEZ8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc10a4Q3UEZ8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc10a4Q3UEZ8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc10a4Q3UEZ8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc10a4Q3UEZ8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc10a4Q3UEZ8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc10a4Q3UEZ8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc10a4Q3UEZ8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc10a4Q3UEZ8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc10a4Q3UEZ8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc10a4Q3UEZ8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc10a4Q3UEZ8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc10a4Q3UEZ8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slc10a4Q3UEZ8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc10a4Q3UEZ8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc10a4Q3UEZ8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc10a4Q3UEZ8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc10a4Q3UEZ8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc10a4Q3UEZ8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc10a4Q3UEZ8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc10a4Q3UEZ8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Slc10a4Q3UEZ8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Slc10a4Q3UEZ8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Slc10a4Q3UEZ8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc10a4Q3UEZ8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc10a4Q3UEZ8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc10a4Q3UEZ8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc10a4Q3UEZ8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc10a4Q3UEZ8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc10a4Q3UEZ8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Slc10a4Q3UEZ8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc10a4Q3UEZ8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc10a4Q3UEZ8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc10a4Q3UEZ8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc10a4Q3UEZ8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc10a4Q3UEZ8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc10a4Q3UEZ8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc10a4Q3UEZ8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc10a4Q3UEZ8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc10a4Q3UEZ8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc10a4Q3UEZ8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc10a4Q3UEZ8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc10a4Q3UEZ8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc10a4Q3UEZ8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc10a4Q3UEZ8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc10a4Q3UEZ8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc10a4Q3UEZ8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc10a4Q3UEZ8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc10a4Q3UEZ8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc10a4Q3UEZ8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc10a4Q3UEZ8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc10a4Q3UEZ8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc10a4Q3UEZ8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc10a4Q3UEZ8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc10a4Q3UEZ8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc10a4Q3UEZ8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc10a4Q3UEZ8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc10a4Q3UEZ8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc10a4Q3UEZ8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc10a4Q3UEZ8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Slc10a4Q3UEZ8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc10a4Q3UEZ8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc10a4Q3UEZ8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc10a4Q3UEZ8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc10a4Q3UEZ8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc10a4Q3UEZ8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc10a4Q3UEZ8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc10a4Q3UEZ8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc10a4Q3UEZ8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc10a4Q3UEZ8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc10a4Q3UEZ8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc10a4Q3UEZ8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc10a4Q3UEZ8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc10a4Q3UEZ8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc10a4Q3UEZ8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc10a4Q3UEZ8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc10a4Q3UEZ8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc10a4Q3UEZ8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc10a4Q3UEZ8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc10a4Q3UEZ8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms