Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5C7

Prickle1, Prickle-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prickle1Q3U5C7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prickle1Q3U5C7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prickle1Q3U5C7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prickle1Q3U5C7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prickle1Q3U5C7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prickle1Q3U5C7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prickle1Q3U5C7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prickle1Q3U5C7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prickle1Q3U5C7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prickle1Q3U5C7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prickle1Q3U5C7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prickle1Q3U5C7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prickle1Q3U5C7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prickle1Q3U5C7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prickle1Q3U5C7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prickle1Q3U5C7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prickle1Q3U5C7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prickle1Q3U5C7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prickle1Q3U5C7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prickle1Q3U5C7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prickle1Q3U5C7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prickle1Q3U5C7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prickle1Q3U5C7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prickle1Q3U5C7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prickle1Q3U5C7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prickle1Q3U5C7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prickle1Q3U5C7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prickle1Q3U5C7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prickle1Q3U5C7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prickle1Q3U5C7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prickle1Q3U5C7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prickle1Q3U5C7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prickle1Q3U5C7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prickle1Q3U5C7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prickle1Q3U5C7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prickle1Q3U5C7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prickle1Q3U5C7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prickle1Q3U5C7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prickle1Q3U5C7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prickle1Q3U5C7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Prickle1Q3U5C7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prickle1Q3U5C7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prickle1Q3U5C7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prickle1Q3U5C7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prickle1Q3U5C7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prickle1Q3U5C7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prickle1Q3U5C7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prickle1Q3U5C7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prickle1Q3U5C7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prickle1Q3U5C7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prickle1Q3U5C7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prickle1Q3U5C7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prickle1Q3U5C7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prickle1Q3U5C7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prickle1Q3U5C7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prickle1Q3U5C7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prickle1Q3U5C7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prickle1Q3U5C7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prickle1Q3U5C7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prickle1Q3U5C7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prickle1Q3U5C7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prickle1Q3U5C7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prickle1Q3U5C7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prickle1Q3U5C7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prickle1Q3U5C7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prickle1Q3U5C7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prickle1Q3U5C7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prickle1Q3U5C7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prickle1Q3U5C7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prickle1Q3U5C7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prickle1Q3U5C7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prickle1Q3U5C7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prickle1Q3U5C7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prickle1Q3U5C7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prickle1Q3U5C7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prickle1Q3U5C7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prickle1Q3U5C7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prickle1Q3U5C7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prickle1Q3U5C7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prickle1Q3U5C7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prickle1Q3U5C7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prickle1Q3U5C7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prickle1Q3U5C7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prickle1Q3U5C7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prickle1Q3U5C7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prickle1Q3U5C7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Prickle1Q3U5C7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prickle1Q3U5C7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prickle1Q3U5C7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prickle1Q3U5C7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prickle1Q3U5C7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prickle1Q3U5C7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prickle1Q3U5C7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Prickle1Q3U5C7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prickle1Q3U5C7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prickle1Q3U5C7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prickle1Q3U5C7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prickle1Q3U5C7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prickle1Q3U5C7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prickle1Q3U5C7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms