Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1T3

Brms1l, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1lQ3U1T3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brms1lQ3U1T3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Brms1lQ3U1T3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brms1lQ3U1T3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Brms1lQ3U1T3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brms1lQ3U1T3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brms1lQ3U1T3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brms1lQ3U1T3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brms1lQ3U1T3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brms1lQ3U1T3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brms1lQ3U1T3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brms1lQ3U1T3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brms1lQ3U1T3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brms1lQ3U1T3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brms1lQ3U1T3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Brms1lQ3U1T3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brms1lQ3U1T3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brms1lQ3U1T3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brms1lQ3U1T3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brms1lQ3U1T3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brms1lQ3U1T3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Brms1lQ3U1T3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brms1lQ3U1T3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brms1lQ3U1T3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brms1lQ3U1T3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brms1lQ3U1T3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brms1lQ3U1T3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brms1lQ3U1T3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brms1lQ3U1T3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Brms1lQ3U1T3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brms1lQ3U1T3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brms1lQ3U1T3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brms1lQ3U1T3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brms1lQ3U1T3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brms1lQ3U1T3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brms1lQ3U1T3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brms1lQ3U1T3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brms1lQ3U1T3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brms1lQ3U1T3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Brms1lQ3U1T3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brms1lQ3U1T3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brms1lQ3U1T3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brms1lQ3U1T3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Brms1lQ3U1T3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brms1lQ3U1T3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brms1lQ3U1T3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brms1lQ3U1T3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brms1lQ3U1T3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brms1lQ3U1T3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brms1lQ3U1T3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brms1lQ3U1T3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brms1lQ3U1T3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brms1lQ3U1T3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brms1lQ3U1T3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms