Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc174Q3U155 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc174Q3U155 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc174Q3U155 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc174Q3U155 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc174Q3U155 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc174Q3U155 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc174Q3U155 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc174Q3U155 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc174Q3U155 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc174Q3U155 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc174Q3U155 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc174Q3U155 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc174Q3U155 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc174Q3U155 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc174Q3U155 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc174Q3U155 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc174Q3U155 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc174Q3U155 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc174Q3U155 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc174Q3U155 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc174Q3U155 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc174Q3U155 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc174Q3U155 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc174Q3U155 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc174Q3U155 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc174Q3U155 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc174Q3U155 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc174Q3U155 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc174Q3U155 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc174Q3U155 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc174Q3U155 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc174Q3U155 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc174Q3U155 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc174Q3U155 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc174Q3U155 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc174Q3U155 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc174Q3U155 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc174Q3U155 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc174Q3U155 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc174Q3U155 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc174Q3U155 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc174Q3U155 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc174Q3U155 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc174Q3U155 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc174Q3U155 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc174Q3U155 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc174Q3U155 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc174Q3U155 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc174Q3U155 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc174Q3U155 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc174Q3U155 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc174Q3U155 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc174Q3U155 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc174Q3U155 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc174Q3U155 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc174Q3U155 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc174Q3U155 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms