Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tbc1d2bQ3U0J8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tbc1d2bQ3U0J8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tbc1d2bQ3U0J8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tbc1d2bQ3U0J8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tbc1d2bQ3U0J8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tbc1d2bQ3U0J8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tbc1d2bQ3U0J8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tbc1d2bQ3U0J8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Tbc1d2bQ3U0J8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tbc1d2bQ3U0J8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tbc1d2bQ3U0J8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tbc1d2bQ3U0J8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tbc1d2bQ3U0J8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Tbc1d2bQ3U0J8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Tbc1d2bQ3U0J8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tbc1d2bQ3U0J8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Tbc1d2bQ3U0J8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tbc1d2bQ3U0J8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tbc1d2bQ3U0J8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Tbc1d2bQ3U0J8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tbc1d2bQ3U0J8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tbc1d2bQ3U0J8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tbc1d2bQ3U0J8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tbc1d2bQ3U0J8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tbc1d2bQ3U0J8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tbc1d2bQ3U0J8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tbc1d2bQ3U0J8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tbc1d2bQ3U0J8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tbc1d2bQ3U0J8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tbc1d2bQ3U0J8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tbc1d2bQ3U0J8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tbc1d2bQ3U0J8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tbc1d2bQ3U0J8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tbc1d2bQ3U0J8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tbc1d2bQ3U0J8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tbc1d2bQ3U0J8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Tbc1d2bQ3U0J8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tbc1d2bQ3U0J8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tbc1d2bQ3U0J8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tbc1d2bQ3U0J8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Tbc1d2bQ3U0J8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tbc1d2bQ3U0J8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tbc1d2bQ3U0J8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tbc1d2bQ3U0J8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tbc1d2bQ3U0J8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tbc1d2bQ3U0J8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Tbc1d2bQ3U0J8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tbc1d2bQ3U0J8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Tbc1d2bQ3U0J8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Tbc1d2bQ3U0J8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tbc1d2bQ3U0J8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tbc1d2bQ3U0J8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tbc1d2bQ3U0J8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tbc1d2bQ3U0J8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tbc1d2bQ3U0J8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tbc1d2bQ3U0J8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tbc1d2bQ3U0J8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tbc1d2bQ3U0J8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tbc1d2bQ3U0J8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tbc1d2bQ3U0J8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tbc1d2bQ3U0J8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tbc1d2bQ3U0J8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tbc1d2bQ3U0J8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tbc1d2bQ3U0J8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tbc1d2bQ3U0J8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tbc1d2bQ3U0J8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tbc1d2bQ3U0J8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tbc1d2bQ3U0J8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tbc1d2bQ3U0J8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tbc1d2bQ3U0J8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tbc1d2bQ3U0J8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tbc1d2bQ3U0J8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tbc1d2bQ3U0J8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tbc1d2bQ3U0J8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tbc1d2bQ3U0J8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tbc1d2bQ3U0J8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tbc1d2bQ3U0J8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms