Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TchpQ3TVW5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TchpQ3TVW5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TchpQ3TVW5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TchpQ3TVW5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TchpQ3TVW5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TchpQ3TVW5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TchpQ3TVW5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TchpQ3TVW5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TchpQ3TVW5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TchpQ3TVW5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TchpQ3TVW5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TchpQ3TVW5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TchpQ3TVW5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TchpQ3TVW5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TchpQ3TVW5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TchpQ3TVW5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TchpQ3TVW5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TchpQ3TVW5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TchpQ3TVW5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TchpQ3TVW5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TchpQ3TVW5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TchpQ3TVW5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TchpQ3TVW5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TchpQ3TVW5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TchpQ3TVW5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TchpQ3TVW5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TchpQ3TVW5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TchpQ3TVW5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TchpQ3TVW5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TchpQ3TVW5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TchpQ3TVW5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TchpQ3TVW5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TchpQ3TVW5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TchpQ3TVW5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TchpQ3TVW5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TchpQ3TVW5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TchpQ3TVW5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TchpQ3TVW5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TchpQ3TVW5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TchpQ3TVW5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TchpQ3TVW5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TchpQ3TVW5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TchpQ3TVW5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TchpQ3TVW5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TchpQ3TVW5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TchpQ3TVW5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TchpQ3TVW5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TchpQ3TVW5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TchpQ3TVW5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TchpQ3TVW5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TchpQ3TVW5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TchpQ3TVW5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TchpQ3TVW5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TchpQ3TVW5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TchpQ3TVW5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TchpQ3TVW5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TchpQ3TVW5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TchpQ3TVW5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TchpQ3TVW5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TchpQ3TVW5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TchpQ3TVW5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TchpQ3TVW5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TchpQ3TVW5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TchpQ3TVW5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TchpQ3TVW5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TchpQ3TVW5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms