Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Ccdc136Q3TVA9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Ccdc136Q3TVA9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Ccdc136Q3TVA9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Ccdc136Q3TVA9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Ccdc136Q3TVA9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Ccdc136Q3TVA9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Ccdc136Q3TVA9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Ccdc136Q3TVA9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Ccdc136Q3TVA9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Ccdc136Q3TVA9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC38.51■■■■□ 3.75
Ccdc136Q3TVA9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
Ccdc136Q3TVA9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
Ccdc136Q3TVA9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
Ccdc136Q3TVA9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
Ccdc136Q3TVA9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Ccdc136Q3TVA9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Ccdc136Q3TVA9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Ccdc136Q3TVA9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Ccdc136Q3TVA9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Ccdc136Q3TVA9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Ccdc136Q3TVA9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Ccdc136Q3TVA9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Ccdc136Q3TVA9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Ccdc136Q3TVA9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Ccdc136Q3TVA9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Ccdc136Q3TVA9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Ccdc136Q3TVA9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Ccdc136Q3TVA9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
Ccdc136Q3TVA9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Ccdc136Q3TVA9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Ccdc136Q3TVA9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Ccdc136Q3TVA9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Ccdc136Q3TVA9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Ccdc136Q3TVA9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Ccdc136Q3TVA9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Ccdc136Q3TVA9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Ccdc136Q3TVA9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Ccdc136Q3TVA9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Ccdc136Q3TVA9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Ccdc136Q3TVA9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Ccdc136Q3TVA9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Ccdc136Q3TVA9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Ccdc136Q3TVA9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
Ccdc136Q3TVA9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
Ccdc136Q3TVA9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
Ccdc136Q3TVA9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Ccdc136Q3TVA9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Ccdc136Q3TVA9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Ccdc136Q3TVA9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Ccdc136Q3TVA9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Ccdc136Q3TVA9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Ccdc136Q3TVA9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Ccdc136Q3TVA9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Ccdc136Q3TVA9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Ccdc136Q3TVA9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Ccdc136Q3TVA9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Ccdc136Q3TVA9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Ccdc136Q3TVA9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.72
Ccdc136Q3TVA9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
Ccdc136Q3TVA9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Ccdc136Q3TVA9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Ccdc136Q3TVA9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Ccdc136Q3TVA9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Ccdc136Q3TVA9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Ccdc136Q3TVA9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Ccdc136Q3TVA9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Ccdc136Q3TVA9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Ccdc136Q3TVA9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
Ccdc136Q3TVA9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Ccdc136Q3TVA9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Ccdc136Q3TVA9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
Ccdc136Q3TVA9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
Ccdc136Q3TVA9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Ccdc136Q3TVA9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Ccdc136Q3TVA9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Ccdc136Q3TVA9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
Ccdc136Q3TVA9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Ccdc136Q3TVA9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Ccdc136Q3TVA9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
Ccdc136Q3TVA9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Ccdc136Q3TVA9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Ccdc136Q3TVA9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Ccdc136Q3TVA9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Ccdc136Q3TVA9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Ccdc136Q3TVA9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Ccdc136Q3TVA9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Ccdc136Q3TVA9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Ccdc136Q3TVA9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Ccdc136Q3TVA9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Ccdc136Q3TVA9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Ccdc136Q3TVA9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Ccdc136Q3TVA9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Ccdc136Q3TVA9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Ccdc136Q3TVA9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Ccdc136Q3TVA9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Ccdc136Q3TVA9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Ccdc136Q3TVA9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Ccdc136Q3TVA9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms