Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21440Q3TTD8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21440Q3TTD8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm21440Q3TTD8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21440Q3TTD8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21440Q3TTD8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21440Q3TTD8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21440Q3TTD8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm21440Q3TTD8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm21440Q3TTD8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm21440Q3TTD8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm21440Q3TTD8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm21440Q3TTD8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm21440Q3TTD8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm21440Q3TTD8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm21440Q3TTD8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm21440Q3TTD8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm21440Q3TTD8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm21440Q3TTD8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm21440Q3TTD8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm21440Q3TTD8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm21440Q3TTD8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm21440Q3TTD8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm21440Q3TTD8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21440Q3TTD8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21440Q3TTD8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21440Q3TTD8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21440Q3TTD8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21440Q3TTD8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21440Q3TTD8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm21440Q3TTD8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21440Q3TTD8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21440Q3TTD8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21440Q3TTD8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21440Q3TTD8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21440Q3TTD8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21440Q3TTD8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21440Q3TTD8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21440Q3TTD8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21440Q3TTD8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21440Q3TTD8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21440Q3TTD8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21440Q3TTD8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21440Q3TTD8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21440Q3TTD8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21440Q3TTD8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21440Q3TTD8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21440Q3TTD8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21440Q3TTD8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21440Q3TTD8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm21440Q3TTD8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 347.2 ms