Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc102aQ3TMW1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc102aQ3TMW1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc102aQ3TMW1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc102aQ3TMW1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc102aQ3TMW1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc102aQ3TMW1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc102aQ3TMW1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc102aQ3TMW1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc102aQ3TMW1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc102aQ3TMW1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc102aQ3TMW1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc102aQ3TMW1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc102aQ3TMW1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc102aQ3TMW1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc102aQ3TMW1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc102aQ3TMW1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc102aQ3TMW1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
Ccdc102aQ3TMW1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ccdc102aQ3TMW1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc102aQ3TMW1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc102aQ3TMW1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc102aQ3TMW1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc102aQ3TMW1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc102aQ3TMW1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc102aQ3TMW1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc102aQ3TMW1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc102aQ3TMW1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc102aQ3TMW1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc102aQ3TMW1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc102aQ3TMW1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc102aQ3TMW1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc102aQ3TMW1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc102aQ3TMW1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc102aQ3TMW1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc102aQ3TMW1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc102aQ3TMW1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc102aQ3TMW1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc102aQ3TMW1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc102aQ3TMW1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc102aQ3TMW1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc102aQ3TMW1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc102aQ3TMW1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc102aQ3TMW1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc102aQ3TMW1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc102aQ3TMW1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc102aQ3TMW1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc102aQ3TMW1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc102aQ3TMW1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms