Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc69Q3TCJ8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc69Q3TCJ8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc69Q3TCJ8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc69Q3TCJ8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc69Q3TCJ8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc69Q3TCJ8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc69Q3TCJ8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc69Q3TCJ8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc69Q3TCJ8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc69Q3TCJ8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc69Q3TCJ8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc69Q3TCJ8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc69Q3TCJ8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc69Q3TCJ8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc69Q3TCJ8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc69Q3TCJ8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc69Q3TCJ8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc69Q3TCJ8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc69Q3TCJ8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc69Q3TCJ8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc69Q3TCJ8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc69Q3TCJ8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc69Q3TCJ8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc69Q3TCJ8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc69Q3TCJ8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc69Q3TCJ8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc69Q3TCJ8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc69Q3TCJ8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc69Q3TCJ8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc69Q3TCJ8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc69Q3TCJ8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc69Q3TCJ8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc69Q3TCJ8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc69Q3TCJ8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms