Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC33

Ccdc127, Coiled-coil domain-containing protein 127, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc127Q3TC33 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc127Q3TC33 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc127Q3TC33 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc127Q3TC33 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc127Q3TC33 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc127Q3TC33 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc127Q3TC33 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc127Q3TC33 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc127Q3TC33 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc127Q3TC33 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc127Q3TC33 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc127Q3TC33 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc127Q3TC33 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc127Q3TC33 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc127Q3TC33 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc127Q3TC33 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc127Q3TC33 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc127Q3TC33 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc127Q3TC33 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc127Q3TC33 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc127Q3TC33 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc127Q3TC33 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc127Q3TC33 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc127Q3TC33 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc127Q3TC33 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc127Q3TC33 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc127Q3TC33 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc127Q3TC33 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc127Q3TC33 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc127Q3TC33 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc127Q3TC33 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc127Q3TC33 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc127Q3TC33 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc127Q3TC33 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc127Q3TC33 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc127Q3TC33 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc127Q3TC33 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc127Q3TC33 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc127Q3TC33 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc127Q3TC33 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc127Q3TC33 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc127Q3TC33 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc127Q3TC33 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc127Q3TC33 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc127Q3TC33 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc127Q3TC33 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc127Q3TC33 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc127Q3TC33 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc127Q3TC33 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc127Q3TC33 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc127Q3TC33 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc127Q3TC33 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc127Q3TC33 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc127Q3TC33 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc127Q3TC33 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc127Q3TC33 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc127Q3TC33 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc127Q3TC33 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc127Q3TC33 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc127Q3TC33 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc127Q3TC33 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc127Q3TC33 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc127Q3TC33 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc127Q3TC33 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc127Q3TC33 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc127Q3TC33 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc127Q3TC33 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc127Q3TC33 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc127Q3TC33 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc127Q3TC33 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc127Q3TC33 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc127Q3TC33 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc127Q3TC33 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms