Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3KNL4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3KNL4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q3KNL4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q3KNL4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3KNL4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3KNL4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q3KNL4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Q3KNL4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q3KNL4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3KNL4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3KNL4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3KNL4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3KNL4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3KNL4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3KNL4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q3KNL4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Q3KNL4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Q3KNL4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q3KNL4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3KNL4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Q3KNL4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3KNL4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q3KNL4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Q3KNL4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3KNL4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3KNL4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3KNL4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3KNL4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Q3KNL4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3KNL4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3KNL4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q3KNL4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3KNL4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3KNL4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3KNL4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3KNL4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3KNL4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3KNL4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3KNL4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3KNL4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3KNL4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3KNL4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3KNL4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3KNL4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3KNL4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3KNL4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3KNL4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3KNL4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3KNL4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3KNL4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3KNL4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3KNL4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3KNL4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3KNL4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3KNL4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3KNL4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3KNL4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3KNL4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3KNL4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3KNL4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3KNL4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3KNL4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3KNL4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3KNL4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3KNL4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3KNL4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3KNL4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3KNL4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3KNL4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3KNL4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3KNL4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3KNL4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3KNL4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3KNL4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3KNL4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3KNL4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3KNL4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3KNL4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3KNL4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3KNL4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3KNL4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3KNL4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3KNL4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3KNL4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3KNL4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3KNL4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3KNL4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3KNL4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3KNL4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3KNL4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3KNL4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3KNL4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3KNL4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3KNL4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3KNL4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3KNL4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3KNL4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3KNL4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3KNL4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms