Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-M3Q31093 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-M3Q31093 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-M3Q31093 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-M3Q31093 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-M3Q31093 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-M3Q31093 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-M3Q31093 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-M3Q31093 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-M3Q31093 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
H2-M3Q31093 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
H2-M3Q31093 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
H2-M3Q31093 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-M3Q31093 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-M3Q31093 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-M3Q31093 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-M3Q31093 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-M3Q31093 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-M3Q31093 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-M3Q31093 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-M3Q31093 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-M3Q31093 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-M3Q31093 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-M3Q31093 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-M3Q31093 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
H2-M3Q31093 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms