Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vax1Q2NKI2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vax1Q2NKI2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Vax1Q2NKI2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Vax1Q2NKI2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Vax1Q2NKI2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Vax1Q2NKI2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Vax1Q2NKI2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vax1Q2NKI2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vax1Q2NKI2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vax1Q2NKI2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vax1Q2NKI2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vax1Q2NKI2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vax1Q2NKI2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Vax1Q2NKI2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vax1Q2NKI2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vax1Q2NKI2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vax1Q2NKI2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vax1Q2NKI2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vax1Q2NKI2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vax1Q2NKI2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vax1Q2NKI2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vax1Q2NKI2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Vax1Q2NKI2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vax1Q2NKI2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vax1Q2NKI2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vax1Q2NKI2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vax1Q2NKI2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vax1Q2NKI2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vax1Q2NKI2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vax1Q2NKI2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vax1Q2NKI2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vax1Q2NKI2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Vax1Q2NKI2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vax1Q2NKI2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vax1Q2NKI2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vax1Q2NKI2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vax1Q2NKI2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vax1Q2NKI2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vax1Q2NKI2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vax1Q2NKI2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vax1Q2NKI2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vax1Q2NKI2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Vax1Q2NKI2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vax1Q2NKI2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Vax1Q2NKI2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vax1Q2NKI2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Vax1Q2NKI2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vax1Q2NKI2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vax1Q2NKI2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vax1Q2NKI2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vax1Q2NKI2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vax1Q2NKI2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vax1Q2NKI2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vax1Q2NKI2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vax1Q2NKI2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vax1Q2NKI2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vax1Q2NKI2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vax1Q2NKI2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Vax1Q2NKI2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vax1Q2NKI2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vax1Q2NKI2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms