Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Spatc1Q148B6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spatc1Q148B6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Spatc1Q148B6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Spatc1Q148B6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Spatc1Q148B6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Spatc1Q148B6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Spatc1Q148B6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Spatc1Q148B6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Spatc1Q148B6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spatc1Q148B6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spatc1Q148B6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Spatc1Q148B6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Spatc1Q148B6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spatc1Q148B6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spatc1Q148B6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Spatc1Q148B6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Spatc1Q148B6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Spatc1Q148B6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spatc1Q148B6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spatc1Q148B6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Spatc1Q148B6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spatc1Q148B6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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