Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF94

Nkpd1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkpd1Q0VF94 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nkpd1Q0VF94 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nkpd1Q0VF94 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nkpd1Q0VF94 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nkpd1Q0VF94 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nkpd1Q0VF94 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nkpd1Q0VF94 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nkpd1Q0VF94 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nkpd1Q0VF94 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nkpd1Q0VF94 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nkpd1Q0VF94 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nkpd1Q0VF94 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nkpd1Q0VF94 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nkpd1Q0VF94 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nkpd1Q0VF94 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nkpd1Q0VF94 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkpd1Q0VF94 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkpd1Q0VF94 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkpd1Q0VF94 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkpd1Q0VF94 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkpd1Q0VF94 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkpd1Q0VF94 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nkpd1Q0VF94 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkpd1Q0VF94 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkpd1Q0VF94 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkpd1Q0VF94 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkpd1Q0VF94 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkpd1Q0VF94 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nkpd1Q0VF94 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nkpd1Q0VF94 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nkpd1Q0VF94 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nkpd1Q0VF94 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nkpd1Q0VF94 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nkpd1Q0VF94 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nkpd1Q0VF94 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nkpd1Q0VF94 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nkpd1Q0VF94 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nkpd1Q0VF94 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nkpd1Q0VF94 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nkpd1Q0VF94 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nkpd1Q0VF94 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nkpd1Q0VF94 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nkpd1Q0VF94 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nkpd1Q0VF94 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nkpd1Q0VF94 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nkpd1Q0VF94 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nkpd1Q0VF94 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms