Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd12Q0VE29 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd12Q0VE29 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd12Q0VE29 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd12Q0VE29 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd12Q0VE29 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd12Q0VE29 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd12Q0VE29 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samd12Q0VE29 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samd12Q0VE29 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Samd12Q0VE29 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Samd12Q0VE29 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Samd12Q0VE29 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samd12Q0VE29 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samd12Q0VE29 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samd12Q0VE29 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samd12Q0VE29 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samd12Q0VE29 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samd12Q0VE29 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samd12Q0VE29 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samd12Q0VE29 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samd12Q0VE29 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samd12Q0VE29 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samd12Q0VE29 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samd12Q0VE29 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samd12Q0VE29 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samd12Q0VE29 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samd12Q0VE29 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd12Q0VE29 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd12Q0VE29 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd12Q0VE29 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd12Q0VE29 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd12Q0VE29 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd12Q0VE29 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd12Q0VE29 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd12Q0VE29 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Samd12Q0VE29 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samd12Q0VE29 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samd12Q0VE29 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samd12Q0VE29 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samd12Q0VE29 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samd12Q0VE29 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Samd12Q0VE29 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samd12Q0VE29 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Samd12Q0VE29 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samd12Q0VE29 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samd12Q0VE29 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samd12Q0VE29 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samd12Q0VE29 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samd12Q0VE29 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samd12Q0VE29 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samd12Q0VE29 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samd12Q0VE29 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samd12Q0VE29 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samd12Q0VE29 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samd12Q0VE29 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Samd12Q0VE29 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Samd12Q0VE29 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samd12Q0VE29 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms