Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Shisal1Q0VBP7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shisal1Q0VBP7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.2 ms