Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Lrriq1Q0P5X1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Lrriq1Q0P5X1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Lrriq1Q0P5X1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Lrriq1Q0P5X1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Lrriq1Q0P5X1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Lrriq1Q0P5X1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Lrriq1Q0P5X1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Lrriq1Q0P5X1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Lrriq1Q0P5X1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Lrriq1Q0P5X1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Lrriq1Q0P5X1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Lrriq1Q0P5X1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Lrriq1Q0P5X1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Lrriq1Q0P5X1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Lrriq1Q0P5X1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Lrriq1Q0P5X1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Lrriq1Q0P5X1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Lrriq1Q0P5X1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Lrriq1Q0P5X1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Lrriq1Q0P5X1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Lrriq1Q0P5X1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Lrriq1Q0P5X1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Lrriq1Q0P5X1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Lrriq1Q0P5X1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Lrriq1Q0P5X1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Lrriq1Q0P5X1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Lrriq1Q0P5X1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Lrriq1Q0P5X1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
Lrriq1Q0P5X1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Lrriq1Q0P5X1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
Lrriq1Q0P5X1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Lrriq1Q0P5X1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Lrriq1Q0P5X1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Lrriq1Q0P5X1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Lrriq1Q0P5X1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Lrriq1Q0P5X1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
Lrriq1Q0P5X1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Lrriq1Q0P5X1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
Lrriq1Q0P5X1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
Lrriq1Q0P5X1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Lrriq1Q0P5X1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Lrriq1Q0P5X1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Lrriq1Q0P5X1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Lrriq1Q0P5X1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Lrriq1Q0P5X1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Lrriq1Q0P5X1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
Lrriq1Q0P5X1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Lrriq1Q0P5X1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Lrriq1Q0P5X1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Lrriq1Q0P5X1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Lrriq1Q0P5X1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Lrriq1Q0P5X1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Lrriq1Q0P5X1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Lrriq1Q0P5X1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Lrriq1Q0P5X1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Lrriq1Q0P5X1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Lrriq1Q0P5X1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Lrriq1Q0P5X1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Lrriq1Q0P5X1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Lrriq1Q0P5X1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Lrriq1Q0P5X1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Lrriq1Q0P5X1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Lrriq1Q0P5X1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Lrriq1Q0P5X1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Lrriq1Q0P5X1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Lrriq1Q0P5X1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Lrriq1Q0P5X1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Lrriq1Q0P5X1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Lrriq1Q0P5X1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Lrriq1Q0P5X1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Lrriq1Q0P5X1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Lrriq1Q0P5X1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Lrriq1Q0P5X1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Lrriq1Q0P5X1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Lrriq1Q0P5X1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Lrriq1Q0P5X1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
Lrriq1Q0P5X1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Lrriq1Q0P5X1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Lrriq1Q0P5X1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Lrriq1Q0P5X1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Lrriq1Q0P5X1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
Lrriq1Q0P5X1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Lrriq1Q0P5X1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Lrriq1Q0P5X1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.42
Lrriq1Q0P5X1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Lrriq1Q0P5X1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Lrriq1Q0P5X1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Lrriq1Q0P5X1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Lrriq1Q0P5X1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Lrriq1Q0P5X1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Lrriq1Q0P5X1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Lrriq1Q0P5X1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Lrriq1Q0P5X1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Lrriq1Q0P5X1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Lrriq1Q0P5X1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Lrriq1Q0P5X1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Lrriq1Q0P5X1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Lrriq1Q0P5X1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Lrriq1Q0P5X1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 281.4 ms