Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Kndc1Q0KK55 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Kndc1Q0KK55 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Kndc1Q0KK55 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Kndc1Q0KK55 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Kndc1Q0KK55 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kndc1Q0KK55 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kndc1Q0KK55 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kndc1Q0KK55 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kndc1Q0KK55 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kndc1Q0KK55 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Kndc1Q0KK55 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kndc1Q0KK55 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kndc1Q0KK55 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kndc1Q0KK55 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kndc1Q0KK55 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kndc1Q0KK55 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kndc1Q0KK55 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kndc1Q0KK55 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kndc1Q0KK55 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kndc1Q0KK55 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kndc1Q0KK55 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kndc1Q0KK55 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kndc1Q0KK55 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kndc1Q0KK55 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kndc1Q0KK55 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kndc1Q0KK55 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kndc1Q0KK55 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kndc1Q0KK55 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kndc1Q0KK55 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kndc1Q0KK55 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kndc1Q0KK55 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kndc1Q0KK55 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kndc1Q0KK55 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Kndc1Q0KK55 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kndc1Q0KK55 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Kndc1Q0KK55 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kndc1Q0KK55 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kndc1Q0KK55 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kndc1Q0KK55 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kndc1Q0KK55 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kndc1Q0KK55 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Kndc1Q0KK55 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kndc1Q0KK55 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Kndc1Q0KK55 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kndc1Q0KK55 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Kndc1Q0KK55 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kndc1Q0KK55 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kndc1Q0KK55 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kndc1Q0KK55 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Kndc1Q0KK55 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Kndc1Q0KK55 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Kndc1Q0KK55 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Kndc1Q0KK55 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kndc1Q0KK55 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kndc1Q0KK55 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Kndc1Q0KK55 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kndc1Q0KK55 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kndc1Q0KK55 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kndc1Q0KK55 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kndc1Q0KK55 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kndc1Q0KK55 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Kndc1Q0KK55 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kndc1Q0KK55 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Kndc1Q0KK55 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kndc1Q0KK55 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kndc1Q0KK55 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kndc1Q0KK55 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kndc1Q0KK55 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Kndc1Q0KK55 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kndc1Q0KK55 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kndc1Q0KK55 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kndc1Q0KK55 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kndc1Q0KK55 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Kndc1Q0KK55 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kndc1Q0KK55 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Kndc1Q0KK55 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Kndc1Q0KK55 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kndc1Q0KK55 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kndc1Q0KK55 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kndc1Q0KK55 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kndc1Q0KK55 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kndc1Q0KK55 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kndc1Q0KK55 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kndc1Q0KK55 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Kndc1Q0KK55 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Kndc1Q0KK55 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Kndc1Q0KK55 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Kndc1Q0KK55 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Kndc1Q0KK55 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kndc1Q0KK55 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kndc1Q0KK55 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kndc1Q0KK55 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kndc1Q0KK55 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kndc1Q0KK55 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Kndc1Q0KK55 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Kndc1Q0KK55 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Kndc1Q0KK55 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Kndc1Q0KK55 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Kndc1Q0KK55 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms