Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cass4Q08EC4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cass4Q08EC4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms