Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q08AU9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q08AU9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q08AU9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q08AU9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q08AU9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q08AU9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q08AU9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q08AU9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q08AU9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q08AU9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q08AU9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q08AU9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q08AU9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q08AU9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q08AU9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q08AU9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q08AU9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q08AU9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q08AU9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q08AU9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q08AU9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q08AU9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q08AU9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q08AU9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q08AU9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Q08AU9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q08AU9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Q08AU9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Q08AU9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q08AU9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q08AU9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q08AU9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q08AU9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q08AU9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q08AU9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q08AU9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q08AU9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q08AU9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q08AU9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q08AU9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q08AU9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q08AU9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q08AU9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q08AU9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q08AU9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q08AU9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q08AU9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q08AU9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q08AU9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q08AU9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q08AU9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q08AU9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q08AU9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q08AU9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q08AU9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q08AU9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q08AU9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q08AU9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q08AU9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q08AU9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q08AU9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Q08AU9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q08AU9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q08AU9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q08AU9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q08AU9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q08AU9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q08AU9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Q08AU9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q08AU9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q08AU9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q08AU9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q08AU9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q08AU9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q08AU9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q08AU9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Q08AU9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q08AU9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q08AU9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q08AU9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q08AU9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q08AU9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q08AU9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Q08AU9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q08AU9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q08AU9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q08AU9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q08AU9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q08AU9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q08AU9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q08AU9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q08AU9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q08AU9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q08AU9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q08AU9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q08AU9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q08AU9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q08AU9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q08AU9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms