Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gata4Q08369 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gata4Q08369 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gata4Q08369 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms