Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cab39Q06138 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cab39Q06138 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Cab39Q06138 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Cab39Q06138 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cab39Q06138 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cab39Q06138 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cab39Q06138 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cab39Q06138 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cab39Q06138 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cab39Q06138 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cab39Q06138 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cab39Q06138 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cab39Q06138 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cab39Q06138 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cab39Q06138 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cab39Q06138 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cab39Q06138 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cab39Q06138 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cab39Q06138 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cab39Q06138 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cab39Q06138 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cab39Q06138 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cab39Q06138 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cab39Q06138 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cab39Q06138 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cab39Q06138 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cab39Q06138 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cab39Q06138 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cab39Q06138 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cab39Q06138 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cab39Q06138 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Cab39Q06138 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cab39Q06138 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cab39Q06138 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cab39Q06138 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cab39Q06138 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cab39Q06138 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cab39Q06138 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cab39Q06138 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cab39Q06138 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cab39Q06138 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cab39Q06138 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cab39Q06138 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms