Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dnal1Q05A62 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Dnal1Q05A62 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnal1Q05A62 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnal1Q05A62 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnal1Q05A62 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnal1Q05A62 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnal1Q05A62 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dnal1Q05A62 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnal1Q05A62 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnal1Q05A62 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnal1Q05A62 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnal1Q05A62 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dnal1Q05A62 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnal1Q05A62 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnal1Q05A62 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dnal1Q05A62 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnal1Q05A62 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnal1Q05A62 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnal1Q05A62 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnal1Q05A62 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dnal1Q05A62 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnal1Q05A62 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnal1Q05A62 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnal1Q05A62 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnal1Q05A62 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnal1Q05A62 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnal1Q05A62 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dnal1Q05A62 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnal1Q05A62 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnal1Q05A62 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dnal1Q05A62 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnal1Q05A62 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnal1Q05A62 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnal1Q05A62 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnal1Q05A62 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnal1Q05A62 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnal1Q05A62 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnal1Q05A62 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnal1Q05A62 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnal1Q05A62 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnal1Q05A62 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnal1Q05A62 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnal1Q05A62 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnal1Q05A62 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnal1Q05A62 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnal1Q05A62 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnal1Q05A62 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnal1Q05A62 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnal1Q05A62 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnal1Q05A62 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnal1Q05A62 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnal1Q05A62 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnal1Q05A62 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnal1Q05A62 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnal1Q05A62 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnal1Q05A62 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnal1Q05A62 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnal1Q05A62 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnal1Q05A62 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnal1Q05A62 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnal1Q05A62 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnal1Q05A62 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnal1Q05A62 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnal1Q05A62 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms