Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hspg2Q05793 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hspg2Q05793 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hspg2Q05793 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hspg2Q05793 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hspg2Q05793 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms