Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sox12Q04890 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Sox12Q04890 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sox12Q04890 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Sox12Q04890 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sox12Q04890 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sox12Q04890 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sox12Q04890 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sox12Q04890 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sox12Q04890 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sox12Q04890 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sox12Q04890 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sox12Q04890 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sox12Q04890 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sox12Q04890 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sox12Q04890 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sox12Q04890 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Sox12Q04890 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sox12Q04890 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sox12Q04890 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sox12Q04890 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sox12Q04890 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sox12Q04890 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sox12Q04890 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sox12Q04890 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sox12Q04890 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sox12Q04890 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sox12Q04890 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sox12Q04890 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sox12Q04890 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sox12Q04890 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Sox12Q04890 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sox12Q04890 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sox12Q04890 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sox12Q04890 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sox12Q04890 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sox12Q04890 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sox12Q04890 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sox12Q04890 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sox12Q04890 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sox12Q04890 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sox12Q04890 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sox12Q04890 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sox12Q04890 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Sox12Q04890 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sox12Q04890 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sox12Q04890 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sox12Q04890 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sox12Q04890 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sox12Q04890 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Sox12Q04890 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sox12Q04890 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sox12Q04890 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Sox12Q04890 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Sox12Q04890 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Sox12Q04890 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sox12Q04890 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sox12Q04890 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sox12Q04890 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sox12Q04890 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sox12Q04890 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sox12Q04890 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sox12Q04890 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sox12Q04890 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sox12Q04890 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sox12Q04890 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sox12Q04890 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sox12Q04890 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sox12Q04890 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sox12Q04890 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sox12Q04890 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sox12Q04890 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Sox12Q04890 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sox12Q04890 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sox12Q04890 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sox12Q04890 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sox12Q04890 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sox12Q04890 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sox12Q04890 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sox12Q04890 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sox12Q04890 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sox12Q04890 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sox12Q04890 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sox12Q04890 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sox12Q04890 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sox12Q04890 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sox12Q04890 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sox12Q04890 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sox12Q04890 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sox12Q04890 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sox12Q04890 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sox12Q04890 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Sox12Q04890 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sox12Q04890 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Sox12Q04890 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sox12Q04890 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sox12Q04890 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sox12Q04890 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sox12Q04890 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sox12Q04890 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms