Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Emx1Q04742 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Emx1Q04742 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Emx1Q04742 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Emx1Q04742 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Emx1Q04742 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Emx1Q04742 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Emx1Q04742 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Emx1Q04742 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Emx1Q04742 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Emx1Q04742 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Emx1Q04742 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Emx1Q04742 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Emx1Q04742 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Emx1Q04742 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms