Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcnb1Q03717 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcnb1Q03717 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Kcnb1Q03717 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kcnb1Q03717 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Kcnb1Q03717 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kcnb1Q03717 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kcnb1Q03717 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kcnb1Q03717 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kcnb1Q03717 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kcnb1Q03717 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Kcnb1Q03717 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcnb1Q03717 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcnb1Q03717 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcnb1Q03717 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcnb1Q03717 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcnb1Q03717 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kcnb1Q03717 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms