Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tff2Q03404 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tff2Q03404 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tff2Q03404 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tff2Q03404 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tff2Q03404 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tff2Q03404 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tff2Q03404 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tff2Q03404 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tff2Q03404 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tff2Q03404 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tff2Q03404 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tff2Q03404 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tff2Q03404 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tff2Q03404 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tff2Q03404 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tff2Q03404 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tff2Q03404 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tff2Q03404 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tff2Q03404 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tff2Q03404 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tff2Q03404 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tff2Q03404 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tff2Q03404 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tff2Q03404 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tff2Q03404 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tff2Q03404 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tff2Q03404 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tff2Q03404 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tff2Q03404 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tff2Q03404 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tff2Q03404 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tff2Q03404 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tff2Q03404 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tff2Q03404 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tff2Q03404 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tff2Q03404 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tff2Q03404 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tff2Q03404 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tff2Q03404 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tff2Q03404 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tff2Q03404 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tff2Q03404 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tff2Q03404 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tff2Q03404 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tff2Q03404 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tff2Q03404 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tff2Q03404 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tff2Q03404 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tff2Q03404 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tff2Q03404 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tff2Q03404 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tff2Q03404 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tff2Q03404 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tff2Q03404 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tff2Q03404 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tff2Q03404 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tff2Q03404 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tff2Q03404 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tff2Q03404 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tff2Q03404 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tff2Q03404 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tff2Q03404 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tff2Q03404 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tff2Q03404 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tff2Q03404 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tff2Q03404 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tff2Q03404 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tff2Q03404 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tff2Q03404 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tff2Q03404 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tff2Q03404 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tff2Q03404 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tff2Q03404 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tff2Q03404 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tff2Q03404 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tff2Q03404 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tff2Q03404 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tff2Q03404 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.2 ms