Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccl7Q03366 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccl7Q03366 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms