Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Mmp11Q02853 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mmp11Q02853 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mmp11Q02853 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms