Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cacna1sQ02789 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cacna1sQ02789 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cacna1sQ02789 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Cacna1sQ02789 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cacna1sQ02789 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cacna1sQ02789 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cacna1sQ02789 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cacna1sQ02789 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cacna1sQ02789 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Cacna1sQ02789 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cacna1sQ02789 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cacna1sQ02789 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cacna1sQ02789 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cacna1sQ02789 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cacna1sQ02789 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cacna1sQ02789 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cacna1sQ02789 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cacna1sQ02789 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cacna1sQ02789 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cacna1sQ02789 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cacna1sQ02789 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cacna1sQ02789 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cacna1sQ02789 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Cacna1sQ02789 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cacna1sQ02789 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cacna1sQ02789 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cacna1sQ02789 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cacna1sQ02789 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cacna1sQ02789 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cacna1sQ02789 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cacna1sQ02789 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cacna1sQ02789 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cacna1sQ02789 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cacna1sQ02789 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cacna1sQ02789 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cacna1sQ02789 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cacna1sQ02789 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cacna1sQ02789 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cacna1sQ02789 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cacna1sQ02789 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Cacna1sQ02789 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cacna1sQ02789 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cacna1sQ02789 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cacna1sQ02789 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cacna1sQ02789 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cacna1sQ02789 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cacna1sQ02789 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cacna1sQ02789 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cacna1sQ02789 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cacna1sQ02789 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cacna1sQ02789 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cacna1sQ02789 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cacna1sQ02789 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cacna1sQ02789 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Cacna1sQ02789 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cacna1sQ02789 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cacna1sQ02789 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cacna1sQ02789 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cacna1sQ02789 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cacna1sQ02789 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cacna1sQ02789 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Cacna1sQ02789 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cacna1sQ02789 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cacna1sQ02789 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cacna1sQ02789 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cacna1sQ02789 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cacna1sQ02789 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cacna1sQ02789 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cacna1sQ02789 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cacna1sQ02789 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Cacna1sQ02789 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cacna1sQ02789 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cacna1sQ02789 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Cacna1sQ02789 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cacna1sQ02789 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cacna1sQ02789 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cacna1sQ02789 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cacna1sQ02789 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cacna1sQ02789 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cacna1sQ02789 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Cacna1sQ02789 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cacna1sQ02789 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cacna1sQ02789 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Cacna1sQ02789 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cacna1sQ02789 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cacna1sQ02789 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cacna1sQ02789 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cacna1sQ02789 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cacna1sQ02789 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cacna1sQ02789 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cacna1sQ02789 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cacna1sQ02789 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cacna1sQ02789 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cacna1sQ02789 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cacna1sQ02789 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cacna1sQ02789 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Cacna1sQ02789 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cacna1sQ02789 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Cacna1sQ02789 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms