Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ly9Q01965 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ly9Q01965 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ly9Q01965 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ly9Q01965 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ly9Q01965 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ly9Q01965 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ly9Q01965 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ly9Q01965 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ly9Q01965 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ly9Q01965 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ly9Q01965 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ly9Q01965 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ly9Q01965 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ly9Q01965 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ly9Q01965 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ly9Q01965 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ly9Q01965 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ly9Q01965 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ly9Q01965 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ly9Q01965 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ly9Q01965 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ly9Q01965 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ly9Q01965 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ly9Q01965 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ly9Q01965 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ly9Q01965 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ly9Q01965 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Ly9Q01965 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ly9Q01965 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ly9Q01965 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ly9Q01965 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ly9Q01965 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ly9Q01965 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ly9Q01965 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ly9Q01965 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ly9Q01965 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ly9Q01965 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ly9Q01965 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ly9Q01965 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ly9Q01965 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ly9Q01965 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ly9Q01965 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ly9Q01965 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ly9Q01965 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ly9Q01965 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ly9Q01965 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ly9Q01965 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ly9Q01965 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ly9Q01965 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ly9Q01965 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ly9Q01965 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ly9Q01965 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ly9Q01965 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ly9Q01965 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ly9Q01965 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ly9Q01965 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ly9Q01965 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ly9Q01965 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ly9Q01965 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ly9Q01965 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ly9Q01965 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ly9Q01965 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ly9Q01965 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ly9Q01965 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ly9Q01965 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ly9Q01965 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ly9Q01965 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ly9Q01965 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Ly9Q01965 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ly9Q01965 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ly9Q01965 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ly9Q01965 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ly9Q01965 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ly9Q01965 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ly9Q01965 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ly9Q01965 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ly9Q01965 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ly9Q01965 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ly9Q01965 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ly9Q01965 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ly9Q01965 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ly9Q01965 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ly9Q01965 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ly9Q01965 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ly9Q01965 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ly9Q01965 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ly9Q01965 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ly9Q01965 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ly9Q01965 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ly9Q01965 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ly9Q01965 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ly9Q01965 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ly9Q01965 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ly9Q01965 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ly9Q01965 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ly9Q01965 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ly9Q01965 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ly9Q01965 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ly9Q01965 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms