Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mc1rQ01727 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mc1rQ01727 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mc1rQ01727 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Mc1rQ01727 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mc1rQ01727 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mc1rQ01727 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mc1rQ01727 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mc1rQ01727 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mc1rQ01727 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mc1rQ01727 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mc1rQ01727 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mc1rQ01727 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mc1rQ01727 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mc1rQ01727 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mc1rQ01727 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mc1rQ01727 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mc1rQ01727 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mc1rQ01727 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mc1rQ01727 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mc1rQ01727 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mc1rQ01727 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mc1rQ01727 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mc1rQ01727 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mc1rQ01727 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mc1rQ01727 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mc1rQ01727 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mc1rQ01727 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mc1rQ01727 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mc1rQ01727 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mc1rQ01727 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mc1rQ01727 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mc1rQ01727 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mc1rQ01727 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mc1rQ01727 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mc1rQ01727 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mc1rQ01727 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mc1rQ01727 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Mc1rQ01727 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mc1rQ01727 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Mc1rQ01727 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms