Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VegfaQ00731 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VegfaQ00731 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VegfaQ00731 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VegfaQ00731 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VegfaQ00731 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VegfaQ00731 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VegfaQ00731 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VegfaQ00731 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VegfaQ00731 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VegfaQ00731 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VegfaQ00731 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VegfaQ00731 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VegfaQ00731 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VegfaQ00731 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VegfaQ00731 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VegfaQ00731 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VegfaQ00731 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VegfaQ00731 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VegfaQ00731 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VegfaQ00731 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VegfaQ00731 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VegfaQ00731 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VegfaQ00731 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VegfaQ00731 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VegfaQ00731 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VegfaQ00731 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VegfaQ00731 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VegfaQ00731 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VegfaQ00731 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VegfaQ00731 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VegfaQ00731 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VegfaQ00731 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VegfaQ00731 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VegfaQ00731 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VegfaQ00731 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VegfaQ00731 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VegfaQ00731 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VegfaQ00731 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VegfaQ00731 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VegfaQ00731 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VegfaQ00731 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VegfaQ00731 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VegfaQ00731 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VegfaQ00731 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VegfaQ00731 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VegfaQ00731 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VegfaQ00731 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VegfaQ00731 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VegfaQ00731 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VegfaQ00731 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VegfaQ00731 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VegfaQ00731 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VegfaQ00731 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VegfaQ00731 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VegfaQ00731 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VegfaQ00731 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VegfaQ00731 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VegfaQ00731 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VegfaQ00731 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VegfaQ00731 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms