Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga4Q00651 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga4Q00651 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga4Q00651 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga4Q00651 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga4Q00651 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga4Q00651 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga4Q00651 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga4Q00651 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga4Q00651 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga4Q00651 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga4Q00651 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga4Q00651 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga4Q00651 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga4Q00651 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga4Q00651 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itga4Q00651 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itga4Q00651 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itga4Q00651 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itga4Q00651 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itga4Q00651 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga4Q00651 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga4Q00651 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Itga4Q00651 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itga4Q00651 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.6 ms